首頁(yè)
產(chǎn)品服務(wù)
心血管疾病系列腎病系列腫瘤系列心血管用藥系列腎病用藥系列二代測(cè)序商業(yè)試劑盒
科研合作
新聞中心
關(guān)于我們
不同檢測(cè)方法應(yīng)對(duì)新冠肺炎疫情
發(fā)布時(shí)間:2020-02-18 18:00:45來(lái)源:
 冠
 肺
 炎

2020年2月12日0時(shí)-24時(shí),湖北新增新冠肺炎病例14840例,較前幾日大幅增加,引發(fā)民眾大量討論。這一日新增病例數(shù)字之所以如此驚人,是因?yàn)楹笔⑴R床診斷病例數(shù)納入確診病例數(shù)進(jìn)行公布。那么,有人要問(wèn)了:是不是核酸檢測(cè)不能成為診斷新冠肺炎的依據(jù)呢?根據(jù)《新型冠狀病毒感染的肺炎診療方案(試行第五版)》,在湖北省的病例診斷分類中雖然增加了“臨床診斷”,但是確診病例診斷標(biāo)準(zhǔn)并沒(méi)有變:

1. 需有呼吸道標(biāo)本或血液標(biāo)本行實(shí)時(shí)熒光RT-PCR檢測(cè)新型冠狀病毒核酸陽(yáng)性;

2. 或病毒基因測(cè)序,與已知的新型冠狀病毒高度同源。

由此可見(jiàn),病毒核酸檢測(cè)仍是確診感染的“金標(biāo)準(zhǔn)”。

021801.jpg

其實(shí),自1月10日武漢新型冠狀病毒基因組序列被首次破譯并對(duì)外公布以來(lái),國(guó)內(nèi)眾多科學(xué)工作者及IVD廠商迅速組織開(kāi)展新型冠狀病毒檢測(cè)試劑的研發(fā)工作,檢測(cè)試劑盒研制成功的好消息不斷從全國(guó)各地傳出,檢測(cè)所需時(shí)間也一再縮短,為診斷新冠病毒肺炎提供了有力的支持。這些檢測(cè)試劑盒運(yùn)用的檢測(cè)方法不盡相同,主要包含以下幾種:熒光定量PCR(qRT-PCR)、片段分析、高通量測(cè)序(NGS)以及特異抗體檢測(cè)等。為全面了解這幾種檢測(cè)方法在新冠病毒診斷不同方面的應(yīng)用,本文對(duì)這幾種檢測(cè)方法做簡(jiǎn)要介紹:

021802.png



 熒 光 定 量 PCR

以2019-nCoV新型冠狀病毒的高度特異性序列為靶區(qū)域,設(shè)計(jì)特異性引物和熒光探針,通過(guò)多重?zé)晒釶CR擴(kuò)增,實(shí)現(xiàn)對(duì)2019-nCoV新型冠狀病毒RNA的檢測(cè)。這種方法也是目前新冠病毒檢測(cè)試劑盒中最常用的檢測(cè)方法。靈敏度及特異性都很高,檢測(cè)時(shí)間在2h左右。同時(shí),這種方法對(duì)樣本采集以及檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室規(guī)范要求很高。若樣本采集不到位,標(biāo)本所帶病毒量較少;實(shí)驗(yàn)操作失誤,造成病毒RNA降解,易造成檢測(cè)出現(xiàn)“假陰性”。為解決此問(wèn)題,可在試劑盒中加入內(nèi)源性內(nèi)參的引物探針,用內(nèi)源性內(nèi)參的結(jié)果來(lái)質(zhì)控標(biāo)本采集提取及實(shí)驗(yàn)操作流程是否無(wú)誤。


021803.png



片 段 分 析

以2019-nCoV新型冠狀病毒的高度特異性序列為靶區(qū)域,設(shè)計(jì)特異性逆轉(zhuǎn)錄引物及擴(kuò)增引物,進(jìn)行普通PCR擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物采用Sanger測(cè)序儀的片段分析功能進(jìn)行檢測(cè),根據(jù)在目標(biāo)片段長(zhǎng)度位置是否出現(xiàn)檢測(cè)峰為依據(jù)進(jìn)行結(jié)果判斷。此方法可根據(jù)不同待檢病毒靶標(biāo)設(shè)計(jì)不同目標(biāo)長(zhǎng)度的產(chǎn)物,進(jìn)行多靶標(biāo)檢測(cè),進(jìn)而區(qū)分患者感染的是哪種冠狀病毒,做到冠狀病毒的分型檢測(cè)。


高 通 量 測(cè) 序

高通量測(cè)序技術(shù)通過(guò)對(duì)待測(cè)目標(biāo)的文庫(kù)構(gòu)建,測(cè)序,序列拼接比對(duì)獲得待測(cè)目標(biāo)基因組序列的全貌。對(duì)在此次武漢疫情爆發(fā)初期,通過(guò)構(gòu)建宏基因組文庫(kù)進(jìn)行NGS測(cè)序鑒定出新型冠狀病毒,并成功繪制出其全基因組序列信息。迅速判斷出此次爆發(fā)的冠狀病毒為一種新的冠狀病毒,與SARS病毒序列高度相似。正是有了新冠病毒全基因組信息,才能使國(guó)內(nèi)科學(xué)家及診斷企業(yè)研發(fā)熒光定量試劑盒用于新冠病毒的檢測(cè)。目前,到了疫情攻堅(jiān)戰(zhàn)的此刻,新冠病毒溯源、流行、變異規(guī)律、變異監(jiān)測(cè)、分子流行病學(xué)、人類感染的發(fā)病機(jī)理等尚待進(jìn)一步明確。


這時(shí),NGS技術(shù)在解析病毒變異情況和追蹤病毒起源及演化方面,扮演著不可替代的核心作用。


此次2019-nCoV病毒為RNA病毒,在傳播過(guò)程存在發(fā)生變異的可能性,并在一定程度上將影響RT-PCR的敏感性,采用高通量測(cè)序方法則可解決這一問(wèn)題,并監(jiān)測(cè)到可能的病毒變異。部分病毒含量較低的樣本,在低于RT-PCR最低檢出限時(shí),采用高通量測(cè)序方法則可以提高陽(yáng)性檢出率,避免漏檢和錯(cuò)檢;對(duì)于疑似感染、多重感染或繼發(fā)感染病原,采用高通量測(cè)序方法則可進(jìn)行并發(fā)檢測(cè),提供更多可能感染的病原信息。


總之,從測(cè)定未知病原,到鑒定已知序列,再到陽(yáng)性樣本的結(jié)果確認(rèn)以及可能存在的序列變異動(dòng)態(tài)監(jiān)控,都可以采用NGS方法有效應(yīng)對(duì)。但NGS方法對(duì)實(shí)驗(yàn)室及實(shí)驗(yàn)人員操作要求是這幾個(gè)檢測(cè)方法中最高的。


021804.png



特 異 抗 體 檢 測(cè)

抗體是機(jī)體感染病毒后,體液免疫應(yīng)答的產(chǎn)物。通常,免疫球蛋白M(IgM)抗體在感染早期出現(xiàn),免疫球蛋白G(IgG)抗體在感染中晚期出現(xiàn)。通過(guò)血清學(xué)檢測(cè),利用抗原抗體的特異性結(jié)合原理,配合標(biāo)記物顯色篩查,實(shí)現(xiàn)對(duì)人體血清、血漿或全血中新型冠狀病毒IgM/IgG抗體的體外定性檢測(cè)。


簡(jiǎn)言之,檢測(cè)特異抗體也可以明確患者是否“近期或既往感染過(guò)新型冠狀病毒”,有助于核酸檢測(cè)陰性但臨床上疑似患者的確診。其主要優(yōu)點(diǎn)在于現(xiàn)場(chǎng)即時(shí)診斷,不要任何檢測(cè)設(shè)備,具備快速、便捷、高效檢測(cè)的特點(diǎn),可用于社區(qū)基層醫(yī)院甚至家庭的早期初步篩查。


另一方面,核酸檢測(cè)多采用上呼吸道樣本(咽拭子為主),采集過(guò)程對(duì)于醫(yī)護(hù)人員暴露風(fēng)險(xiǎn)極大,而抗體檢測(cè)是通過(guò)血液樣本檢測(cè),感染風(fēng)險(xiǎn)降低。但抗體檢測(cè)容易受到血液標(biāo)本中的一些干擾物質(zhì)(如非特異IgM、類風(fēng)濕因子、溶血所致的高濃度度血紅蛋白等)的存在而出現(xiàn)“假陽(yáng)性”結(jié)果,所以抗體檢測(cè)必須采用IgM 和IgG同時(shí)檢測(cè)且通常需多次動(dòng)態(tài)檢測(cè)來(lái)確認(rèn)。


因此,特異抗體檢測(cè)陽(yáng)性不能像病毒核酸檢測(cè)陽(yáng)性一樣作為病毒感染的“金標(biāo)準(zhǔn)”


總    結(jié)

每種檢測(cè)方法都有各自的優(yōu)缺點(diǎn),為防止錯(cuò)檢、漏檢,應(yīng)綜合考慮適用場(chǎng)所、人群及疑似患者病毒攜帶量等問(wèn)題,必要時(shí)根據(jù)臨床診斷進(jìn)行選擇。精準(zhǔn)的qRT-PCR檢測(cè),配合必要的基因測(cè)序復(fù)核及抗體水平的評(píng)估是診斷新冠病毒最佳組合。


關(guān)于我們


推薦新聞

咨詢服務(wù)熱線

+86 10 5849 9280

? Copyright - 安智因 京ICP備18055458號(hào)-1