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與心律失常性猝死相關(guān)的CPVT和短QT綜合征的基因有效性評(píng)價(jià)
發(fā)布時(shí)間:2021-10-20 19:00:00來源:
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最近在《European Heart Journal》上發(fā)表了題為“Evaluation of gene validity for CPVT and short QT syndrome in sudden arrhythmic death”的文章,對(duì)此前報(bào)道的與CPVT和SQTS相關(guān)的主要基因進(jìn)行再次分析評(píng)級(jí)。


背景介紹


兒茶酚胺敏感型室性心動(dòng)過速(CPVT)和短QT綜合征(SQTS)是可導(dǎo)致猝死的遺傳性心律失常性疾病。據(jù)報(bào)道,許多基因可導(dǎo)致這兩種疾病,但支持這些基因與疾病相關(guān)的證據(jù)差異很大。為了確保CPVT和SQTS患者的基因信息得到適當(dāng)利用,作者對(duì)先前報(bào)道的基因重新進(jìn)行了循證評(píng)估。


研究方法


三個(gè)不同團(tuán)隊(duì)均參考ClinGen Gene Curation Framework version 7,分別對(duì)11個(gè)與CPVT相關(guān)基因和9個(gè)與SQTS相關(guān)基因的所有已發(fā)表證據(jù)再次評(píng)估審核。最后,三個(gè)團(tuán)隊(duì)的匯總結(jié)果由一個(gè)離子通道病專家小組進(jìn)行最終審核分類。


研究結(jié)果


11個(gè)與CPVT相關(guān)基因中,有7個(gè)基因與疾病的相關(guān)性證據(jù)為“明確”或“中等”,其中4個(gè)基因RYR2CALM1、CALM2CALM3為常染色體顯性遺傳,CALM1、CALM2CALM3CALM基因家族,編碼相同的蛋白質(zhì)(鈣調(diào)節(jié)蛋白),這些基因中的任何變異都可能導(dǎo)致LQTS表型,有大量文獻(xiàn)報(bào)道這些變異即會(huì)導(dǎo)致CPVT表型的單獨(dú)出現(xiàn),也會(huì)引起LQT和CPVT的混合表型(靜息時(shí)QT延長(zhǎng)和運(yùn)動(dòng)誘發(fā)的多態(tài)性室性心律失常);另外3個(gè)基因CASQ2、TRDN、TECRL為常染色體隱性遺傳。此外,4個(gè)有爭(zhēng)議的CPVT相關(guān)基因中有3個(gè)(KCNJ2PKP2SCN5A)被專家組認(rèn)為并不能導(dǎo)致典型的CPVT臨床表型,作者目前調(diào)查的panel中沒有PKP2基因,最近的一份報(bào)告中,在1名已診斷為兒茶酚胺敏感型多態(tài)性室性心動(dòng)過速的患者中發(fā)現(xiàn)了該基因的截短變異,故作者將PKP2納入了重新評(píng)估的過程。最后1個(gè)基因(ANK2)在人群中太常見,可能不會(huì)導(dǎo)致該疾病。具體結(jié)果詳見表1。


9個(gè)與SQTS相關(guān)基因中,有1個(gè)基因(KCNH2)被歸類為明確基因,另外3個(gè)基因(KCNQ1、KCNJ2、SLC4A3)具有強(qiáng)或中等證據(jù),在作者目前調(diào)查的檢測(cè)panel中,并未發(fā)現(xiàn)SLC4A3基因,且專家組對(duì)該基因與SQTS疾病的相關(guān)性結(jié)論不一致;SLC22A5基因不會(huì)引起SQTS,但該基因?qū)е碌娜碓l(fā)性肉堿缺乏癥可能類似SQTS。SQTS基因的大部分遺傳證據(jù)來自極少數(shù)變異(KCNJ2中有5個(gè),KCNH2中有2個(gè),KCNQ1/SLC4A3中有1個(gè))具體結(jié)果詳見表2。


       表1:兒茶酚胺敏感型室性心動(dòng)過速基因的證據(jù)分類

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       表2:短QT綜合征的基因證據(jù)分類

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結(jié)論


該研究參考ClinGen curation framework,全面重新的評(píng)估了與CPVT和SQTS相關(guān)的主要基因的證據(jù)。被確定為具有明確致病證據(jù)的基因應(yīng)納入這些疾病的臨床基因檢測(cè)panel,證據(jù)不足的基因或?qū)е缕渌穆墒С1硇偷幕蛟跍y(cè)序后應(yīng)謹(jǐn)慎解釋。這將使診斷性的基因檢測(cè)方法更加循證,有助于減少不確定性或假陽(yáng)性結(jié)果的數(shù)量。文章建議在患者治療之前,應(yīng)采用一種系統(tǒng)的、基于證據(jù)的方法來評(píng)估所有已報(bào)道的或新的基因-疾病關(guān)系的有效性,在調(diào)查這些疾病的遺傳原因時(shí),應(yīng)注意遺傳和表型數(shù)據(jù),進(jìn)而充分評(píng)估基因與疾病的相關(guān)性。


參考文獻(xiàn)

Walsh R, Adler A, Amin AS, Abiusi E, Care M, Bikker H, Amenta S, Feilotter H, Nannenberg EA, Mazzarotto F, Trevisan V, Garcia J, Hershberger RE, Perez MV, Sturm AC, Ware JS, Zareba W, Novelli V, Wilde AAM, Gollob MH. Evaluation of gene validity for CPVT and short QT syndrome in sudden arrhythmic death. Eur Heart J. 2021 Sep 24:ehab687.


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