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精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)實(shí)例:看乳腺癌患者如何選擇基因檢測(cè)
發(fā)布時(shí)間:2020-04-08 19:00:30來(lái)源:
摘要

精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)(基因檢測(cè))在乳腺癌的個(gè)體化治療中起到重要的作用。腫瘤的形成過(guò)程是由體細(xì)胞突變引起的,這種突變會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞不受控制的生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移。腫瘤基因檢測(cè)主要包括腫瘤體細(xì)胞突變檢測(cè)和血液胚系突變檢測(cè),體細(xì)胞突變是在受孕后產(chǎn)生的,是不可遺傳的,能為腫瘤復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)和個(gè)體化治療提供指導(dǎo);胚系突變存在于人體的所有細(xì)胞中,是可遺傳的,可用于更準(zhǔn)確的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估。隨著下一代測(cè)序的不斷發(fā)展和檢測(cè)成本的降低,腫瘤基因檢測(cè)的選擇不斷增加,也包括直接面向消費(fèi)者(direct-to-consumer, DTC)的胚系突變檢測(cè)。

本文通過(guò)一個(gè)實(shí)際案例講解基因檢測(cè)能為乳腺癌患者及其家庭帶來(lái)什么?需要注意的是,家庭成員的遺傳性腫瘤基因檢測(cè)應(yīng)包括對(duì)可能的結(jié)果、不良影響、臨床管理選擇和保險(xiǎn)覆蓋范圍的討論,同時(shí)還應(yīng)關(guān)注有關(guān)隱私或歧視等問(wèn)題。



案例概述:

一位47歲的德系猶太女性,臨床診斷為0.9cm單側(cè)乳腺癌,ER+,PR+,HER2-,無(wú)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移。她的兩個(gè)姑母都有乳腺癌病史,但她的家族中此前沒(méi)有人接受過(guò)基因檢測(cè)。她本人需要做出手術(shù)、放療和/或化療治療方案的選擇,還擔(dān)心她的兩個(gè)女兒是否有罹患腫瘤的風(fēng)險(xiǎn)。她此前聽(tīng)說(shuō)過(guò)遺傳性腫瘤基因檢測(cè),只是認(rèn)為父系家族史(即姑母患乳腺癌)與此無(wú)關(guān)。現(xiàn)在,她自己確診乳腺癌,想知道基因檢測(cè)如何指導(dǎo)她的治療,并對(duì)她的家庭有什么幫助?





腫瘤基因檢測(cè)對(duì)患者的治療

有哪些影響?



HOW WOULD TUMOR GENETIC TESTING INFLUENCE MANAGEMENT OF THIS PATIENT?



Q1: 患者咨詢下一步的治療方案以及如何選擇腫瘤基因檢測(cè)?

首先要讓患者了解腫瘤基因檢測(cè)的概念,如果選擇輔助化療方案,需要考慮腫瘤的大小、分級(jí)、特征和淋巴結(jié)累及。


I期乳腺腫瘤的預(yù)后一般較好,但約13%的T1N0(無(wú)淋巴結(jié)累及)和20%的T1N1(1至3個(gè)淋巴結(jié)累及)腫瘤在接受5年的激素治療后仍會(huì)復(fù)發(fā),其中20%~30%會(huì)發(fā)生轉(zhuǎn)移,可能是致命的。乳腺腫瘤的常規(guī)病理評(píng)估是通過(guò)免疫組織化學(xué)染色方法檢測(cè)是否存在ERPR、和HER2過(guò)表達(dá)。這與激素和HER2靶向治療方案的選擇相關(guān)。


另外,腫瘤基因表達(dá)譜檢測(cè)可指導(dǎo)復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)分層。在美國(guó),目前34.4%的乳腺癌患者會(huì)進(jìn)行多基因表達(dá)譜分析,用于評(píng)估輔助化療對(duì)早期乳腺癌的療效。例如,21基因表達(dá)譜分析用于對(duì)淋巴結(jié)陰性、ER陽(yáng)性、PR陽(yáng)性的患者進(jìn)行復(fù)發(fā)評(píng)分(recurrence score, RS),根據(jù)復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)來(lái)判斷是否進(jìn)行化療。RS的范圍為0-100。Sparano等的研究表明,ER+、PR+、HER2-、淋巴結(jié)陰性以及低至中度RS的腫瘤患者中,內(nèi)分泌治療的療效并不遜于內(nèi)分泌聯(lián)合化療,這能使許多患者免于化療的副作用和負(fù)擔(dān)。


NCI-MATCH(治療選擇的分子分析)試驗(yàn)正在探索基于遺傳變異的系統(tǒng)治療的有效性,入組標(biāo)準(zhǔn)為標(biāo)準(zhǔn)治療失敗或患有罕見(jiàn)類型腫瘤且沒(méi)有標(biāo)準(zhǔn)治療的患者。乳腺癌相關(guān)的分子靶點(diǎn)還包括HER2擴(kuò)增、PTEN、PIK3CA、c-KITmTOR等。隨著新療法的不斷涌現(xiàn),這些基因相關(guān)的臨床試驗(yàn)正在展開(kāi)。對(duì)驅(qū)動(dòng)基因突變及其藥物治療的深入了解可能會(huì)帶來(lái)新的治療選擇。然而,用于乳腺癌的體細(xì)胞腫瘤檢測(cè)的陽(yáng)性檢出率較低。



Q2:患者咨詢腫瘤取樣的局限性?

腫瘤基因檢測(cè)的一個(gè)局限性是腫瘤內(nèi)部的異質(zhì)性。腫瘤是高度異質(zhì)性且不斷進(jìn)化的,腫瘤內(nèi)存在明顯的細(xì)胞亞群。隨著新突變的獲得,克隆株會(huì)持續(xù)進(jìn)化。腫瘤活檢或分析時(shí)所用的一部分樣本不可避免地會(huì)出現(xiàn)代表性不足的問(wèn)題,例如,被檢測(cè)的腫瘤部分可能并不包括所有的克隆細(xì)胞,或是否有足夠數(shù)量的具有最大轉(zhuǎn)移潛能的細(xì)胞,這可能會(huì)影響治療方案的選擇。因此,通過(guò)對(duì)腫瘤的幾個(gè)部分分別進(jìn)行取樣,可能會(huì)最大程度地降低單一位置取樣代表性不足的風(fēng)險(xiǎn)。



患者的第一項(xiàng)選擇:乳腺癌21基因表達(dá)譜檢測(cè)

(檢測(cè)目的:復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估)


腫瘤分子檢測(cè)能夠?yàn)榛颊呦到y(tǒng)化療和靶向治療的選擇提供科學(xué)依據(jù)。該患者ER+,PR+,HER2-,無(wú)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移,選擇進(jìn)行乳腺癌21基因檢測(cè)(表達(dá)譜分析),檢測(cè)結(jié)果為低度復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn),患者決定不進(jìn)行輔助化療。





胚系基因檢測(cè)對(duì)患者的診療

和風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估有什么作用



HOW WOULD TUMOR GENETIC TESTING INFLUENCE MANAGEMENT OF THIS PATIENT?



Q3:由于自己確診乳腺癌,患者擔(dān)心她的女兒是否有罹患乳腺癌的風(fēng)險(xiǎn),還擔(dān)心自己將來(lái)有沒(méi)有可能患其他類型的腫瘤?

目前,胚系基因panels檢測(cè)已被納入乳腺癌分期。胚系基因檢測(cè)用于檢測(cè)與可能增加腫瘤風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)的基因突變,用于指導(dǎo)乳腺癌的治療方案選擇,還能評(píng)估原發(fā)性乳腺癌或其他腫瘤的發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)。與乳腺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)基因主要包括ATM、BRCA1/2CDH1、CHEK2、NF1、PALB2PTEN、TP53、STK11等(表1)。其中最常見(jiàn)的乳腺癌高?;虬?em style="margin: 0px; padding: 0px; max-width: 100%; box-sizing: border-box !important; overflow-wrap: break-word !important;">BRCA1、BRCA2、TP53PTEN,這些基因都是常染色體顯性遺傳(AD),突變攜帶者的一級(jí)親屬有50%的機(jī)會(huì)攜帶相同突變。其他基因如ATM、CDH1、CHEK2NF1PALB2等的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)較小。2011年以前,多數(shù)乳腺癌女性只檢測(cè)BRCA1/2,但現(xiàn)在針對(duì)遺傳性乳腺癌的5~50個(gè)基因組合檢測(cè)已非常普遍。


對(duì)于沒(méi)有乳腺癌的女性,如符合以下任一乳腺癌家族史,建議選擇胚系基因檢測(cè):(1)乳腺癌的確診年齡≤45歲;(2)三陰性乳腺癌的確診年齡≤60歲;(3)≥2例原發(fā)性乳腺癌(雙側(cè)或同側(cè));(4)男性乳腺癌;(5)德系猶太人血統(tǒng)在任何年齡被診斷為乳腺癌;(6)個(gè)人胰腺癌、轉(zhuǎn)移性前列腺癌或卵巢癌病史;(7)無(wú)乳腺癌病史,但一、二級(jí)親屬高度懷疑有遺傳性腫瘤,應(yīng)盡可能先對(duì)受累個(gè)體進(jìn)行檢測(cè)。此外,選擇胚系基因檢測(cè)前,還需關(guān)注醫(yī)療保險(xiǎn)賠付和檢測(cè)服務(wù)等因素,如實(shí)驗(yàn)室的經(jīng)驗(yàn)、樣本類型、樣本量、檢測(cè)周期、檢測(cè)的基因及突變類型、變異解析的準(zhǔn)確性、檢測(cè)報(bào)告、是否免費(fèi)進(jìn)行直系親屬驗(yàn)證等。



患者的第二項(xiàng)選擇:遺傳性乳腺癌基因檢測(cè)

(檢測(cè)目的:治療指導(dǎo)和風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估)


患者為德系猶太女性,50歲前確診乳腺癌,符合進(jìn)行胚系基因檢測(cè)的標(biāo)準(zhǔn)。患者選擇了胚系突變檢測(cè),檢出BRCA2基因6174delT突變,該突變是德系猶太人中發(fā)現(xiàn)的3個(gè)BRCA1/2明確致病突變之一。

對(duì)于攜帶BRCA2突變的個(gè)體,未來(lái)10年患原發(fā)性乳腺癌的風(fēng)險(xiǎn)為10.8%,70歲時(shí)的患病風(fēng)險(xiǎn)為62%,患者決定進(jìn)行雙側(cè)乳腺切除術(shù)。這項(xiàng)手術(shù)并沒(méi)有徹底消除乳腺癌的風(fēng)險(xiǎn),但卻顯著降低了發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。此外,考慮到攜帶BRCA2突變的個(gè)體患卵巢癌的風(fēng)險(xiǎn)為16.5%-27%,且患者已是絕經(jīng)后狀態(tài),決定同時(shí)進(jìn)行預(yù)防性雙側(cè)輸卵管、卵巢切除術(shù)。





胚系基因檢測(cè)對(duì)患者親屬的

風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估有什么作用?





Q4:繼患者檢出BRCA2 致病突變并采取了相應(yīng)的治療和干預(yù)措施之后,在得知她的兩個(gè)女兒(19歲和25歲)都有50%的機(jī)會(huì)遺傳該突變時(shí),她想知道什么時(shí)候應(yīng)考慮女兒的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估?

經(jīng)過(guò)相應(yīng)遺傳咨詢,25歲的大女兒決定立刻進(jìn)行檢測(cè),而小女兒決定再等等。大女兒的檢測(cè)結(jié)果顯示,她遺傳了媽媽的BRCA2突變,醫(yī)生建議她從30歲開(kāi)始每年進(jìn)行對(duì)比磁共振成像篩查,同時(shí)每年進(jìn)行乳房X光檢查;還建議她每6~12個(gè)月接受一次臨床乳房檢查,并教會(huì)她進(jìn)行乳房自我檢查。此外,她還決定開(kāi)始使用口服避孕藥,這可以將她罹患卵巢癌的風(fēng)險(xiǎn)降低40%。



患者的第三項(xiàng)選擇:遺傳性乳腺癌基因檢測(cè)

(檢測(cè)目的:無(wú)癥狀親屬的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估)


經(jīng)過(guò)相應(yīng)的治療、雙側(cè)乳房切除和預(yù)防性輸卵管卵巢切除術(shù)后,患者覺(jué)得自己在面對(duì)腫瘤時(shí)很好地行使了選擇權(quán),讓自己遠(yuǎn)離腫瘤。她對(duì)自己25歲女兒感到有些愧疚,但她相信自己是一個(gè)很好的榜樣,盡管患癌風(fēng)險(xiǎn)增加仍然可以生活得很好。


總結(jié)

這個(gè)實(shí)例展現(xiàn)了腫瘤胚系突變檢測(cè)如何指導(dǎo)乳腺癌患者的個(gè)體化治療和管理,以及幫助親屬進(jìn)行風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估。基因檢測(cè)為乳腺癌和其他類型腫瘤的篩查、預(yù)防、早期發(fā)現(xiàn)和治療提供了新的機(jī)會(huì)。隨著這一領(lǐng)域的不斷發(fā)展,以及人們對(duì)腫瘤異質(zhì)性的進(jìn)一步了解,癌癥分子圖譜的改進(jìn),加上更多治療和臨床轉(zhuǎn)歸相關(guān)的數(shù)據(jù),勢(shì)必會(huì)帶來(lái)更多特異性、有效且安全的腫瘤治療方法。此外,隨著NGS成本的降低和變異解讀能力的提高,針對(duì)人群的腫瘤胚系基因篩查的有效性將會(huì)得到進(jìn)一步評(píng)估。


延伸閱讀


01
乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)基因及其治療指導(dǎo)意義

不同的致病基因?qū)?yīng)不同的治療和干預(yù)措施,表1總結(jié)了攜帶上述基因突變的臨床意義。例如,對(duì)于攜帶BRCA1/2致病或可能致病突變的個(gè)體,建議采取相應(yīng)的干預(yù)措施,例如,1)降低風(fēng)險(xiǎn)的輸卵管卵巢切除術(shù),預(yù)防性雙側(cè)乳房切除術(shù);2)口服避孕藥降低卵巢癌風(fēng)險(xiǎn);3)可以考慮他莫昔芬和PARP抑制劑;4)建議從25歲開(kāi)始,每6-12個(gè)月進(jìn)行一次臨床乳房檢查,每年進(jìn)行一次核磁共振和乳房X光檢查。

表1 乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)基因及其治療指導(dǎo)意義

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02
乳腺癌胚系基因檢測(cè)的治療指導(dǎo)

胚系基因檢測(cè)在乳腺癌治療中起重要作用(見(jiàn)圖1)。建議乳腺癌患者(女性或男性)進(jìn)行胚系和體細(xì)胞基因檢測(cè),胚系基因檢測(cè)用于靶向藥物的選擇(如PARP抑制劑),評(píng)估未來(lái)原發(fā)腫瘤的風(fēng)險(xiǎn);體細(xì)胞基因檢測(cè)用于復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)分層并評(píng)估是否能從系統(tǒng)化療中獲益。


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圖1 乳腺癌胚系基因檢測(cè)的治療指導(dǎo)


根據(jù)2015年ACMG遺傳變異分類標(biāo)準(zhǔn)與指南,可將基因變異分為5類致病性、可能致病性、臨床意義未明(VUS、可能良性或良性。隨著基因檢測(cè)panels中基因數(shù)量的不斷增加,發(fā)現(xiàn)1個(gè)或多個(gè)VUS的概率也隨之增大。大多數(shù)VUSs最終將被重新分類為良性或可能良性;然而,這會(huì)增加患者的焦慮,也會(huì)增加臨床醫(yī)生的疑慮。盡管大多數(shù)VUSs可能是良性的,但那些沒(méi)有腫瘤病史,卻有乳腺癌家族史的VUSs患者更有可能因此選擇雙側(cè)預(yù)防性乳房切除術(shù)。胚系基因檢測(cè)前的遺傳咨詢應(yīng)包括,VUSs檢測(cè)結(jié)果帶來(lái)的不確定風(fēng)險(xiǎn),以及可能會(huì)增加某些人的焦慮等方面的討論。臨床醫(yī)生也可以考慮將這些患者轉(zhuǎn)診給遺傳學(xué)專家,幫助他們做進(jìn)一步的變異解析、家族共分離研究或?qū)ψ儺愑绊懙难芯?。遺傳咨詢師在對(duì)患者進(jìn)行基因檢測(cè)的解釋和建議方面發(fā)揮著重要作用。



參考文獻(xiàn):

Tischler J, et al. Cases in Precision Medicine: The Role of Tumor and Germline Genetic Testing in Breast Cancer Management. Ann Intern Med. 2019.


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